O objetivo principal da proposta é desenvolver softwares para análises genômicas, a serem executados em ambiente cooperativo e distribuído, na Região Centro-Oeste. Este objetivo pode ser contextualizado dentro dos esforços mundiais que vem sendo hoje realizados para buscar metodologias que tentam desvendar os segredos contidos nas seqüências dos genomas e nas suas interações. A Bioinformática tem um papel primordial neste contexto, pois esta área tem sido responsável por gerar as ferramentas computacionais capazes de analisar genomas em larga escala, de forma relativamente rápida e a um custo baixo, quando comparado aos custos de laboratórios de Biologia Molecular. Assim, podemos afirmar que a Bioinformática é uma das chaves para o sucesso da análise de dados de projetos genômicos. O fortalecimento da pesquisa nesta área é estratégico para fornecer o suporte necessário às áreas experimentais da Biologia Molecular e para impulsionar significativamente as descobertas cientificas em genômica. Neste contexto, a análise computacional dos dados gerados ou existentes é de fundamental importância para concretizar as potencialidades oriundas de conhecer o genoma completo ou parcial de um organismo.

Para o pais, torna-se estratégica a mudança de enfoque, concentrando-se mais na análise de dados existentes do que na geração destes. Uma análise computacional criteriosa fornece indicações precisas sobre funcionalidades ou interações entre genes, a um custo muito baixo quando comparado aos investimentos em reagentes e tempo de trabalho. É claro, porém, que apenas a análise computacional é insuficiente e a validação experimental é sempre necessária, mas as evidências computacionais otimizam as decisões e direcionam os experimentos.

Particularmente, três áreas de Bioinformática serão estudadas: genômica comparativa, identificação de RNAs não-codificadores e redes metabólicas. Os softwares obtidos serão disponibilizados em um sistema distribuído ligando instituições desta região, permitindo melhor distribuição, compartilhamento e alocação de recursos computacionais, pelo gerenciamento da execução simultânea de tarefas computacionais, distribuindo-as entre um grupo de computadores de forma eficiente e tolerante a falhas, visando principalmente maximizar o potencial computacional das instituições integrantes do sistema. Por fim, algoritmos de comparação de seqüências biológicas serão implementados em hardware, visando assim acelerar o tempo de obtenção de resultados.

Artigo completo sobre o projeto Biofoco 3 (PDF 2,5MB)

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